Tecmo обещает 80-страничную книгу Ninja Gaiden Treasury и комикс от Team NINJA, проливающий свет на события, предшествовавшие тем, что описаны в игре. В комплект коллекционного издания также входит набор иллюстраций и небольшое руководство, включающее в себя информацию об оружии четырех персонажей, описания комбинаций ударов и подсказки для режимов Story Mode и Team Missions. Наконец, обладателям Ninja Gaiden 2 Sigma Collector's Edition достанется саундтрек на CD и эксклюзивный загружаемый костюм.